Кафедра медичної та фармацевтичної хімії працює згідно угоди про науково-технічне співробітництво з Інститутом органічної хімії НАН України, підписаної у 2007 році. Співробітниками кафедри медичної та фармацевтичної хімії БДМУ були розроблені умови синтезу 4-функціоналізованихпіразолів та 4-хлор-5-формілімідазолів. Науковцями Інституту органічної хімії за допомогою сучасних фізико-хімічних методів встановлено їх будову та досліджуються хімічні й біологічні властивості.
Науковці кафедри плідно співпрацюють з Інститутом біології, хімії та біоресурсів Чернівецького національного університету.